Центральный персонаж фильма - наемный убийца, генетически созданный как идеальная машина для убийства и известный только по последним двум цифрам штрих-кода, вытатуированного на задней стороне его шеи. Он - конечный продукт многолетних исследований, преемник предыдущих сорока шести агентов-клонов, наделен непревзойденной силой, скоростью, выдержкой и умом. Его очередная цель – мега-корпорация, которая планирует раскрыть тайну истории Агента 47, чтобы создать армию убийц, чьи возможности превзойдут даже его собственные. Объединившись с молодой женщиной, которая, возможно, обладает тайным знанием, как преодолеть их мощных и скрытых врагов, Агент 47 узнает впечатляющие подробности собственного происхождения и вступает в героическую битву со своим самым опасным противником.